自序--緒論, 晚明以來中國思想現代轉換中的幾個議題--第一 章, 從“理學別派”到士人佛學: 由明清思想史的主題演進試論近代唯識學的思想 特質--第二章, 王陽明《大學》論與“朱陸”問題的展開: 兼論王學流衍與“朱陸”問題在晚明背景下的重 構--第三章, 從“朱陸”到“儒釋”: 清代思想史的另一種可能性: 以彭紹升的“儒釋”觀為中心--第四章, 生死‧道德‧革命: 晚清“志士”理想中的個體, 社會與道德--第五章, “操齊物以解紛, 明天倪以為量”: 論章太炎“齊物”哲學的形成及其意趣--第六章, 方法與宗旨之間: 試論現代學術嬗變中哲學, 義理學, 經史之學的離合及現代佛學對其的導引--第七章, 經, 史, 儒關係的重構與“批判儒學”之建立: 以《儒學五論》為中心試論蒙文通“儒學”觀念 的特質--第八章, “哲學”, “史學”與“量論”：現代中國學術思想史上的 “真理”, “知識”與“價值”問題--第九章, 哲學‧文明‧現代性: “古今中西”之爭中的“中國哲學”--第十章 “法相”與“唯識”何以分宗?: 試論“法相, 唯識分宗說”在歐陽競無佛學思想中的奠基地位